El Fondo de Desarrollo Indígena Guatemalteco FODIGUA, es un organismo Nacional, desconcentrada, con estructura bipartita, ya que está conformado por un Consejo Directivo Nacional, conformada por personas propuestas por el gobierno central y organizaciones de la sociedad civil de los pueblos indígenas, con cobertura geográfica en las regiones lingüísticas del país.

Su base legal la constituye el Acuerdo gubernativo 435-94 por medio del cual se crea el FODIGUA de urgencia y necesidad nacional. Las modificaciones se sustentan en los acuerdos gubernativos 500-95; 354-96; 149-97; 95-2003; 32-2005 y 158-2006.